Kuidas arvutada peptiidide isoelektriline punkt

Autor: Vivian Patrick
Loomise Kuupäev: 13 Juunis 2021
Värskenduse Kuupäev: 15 November 2024
Anonim
Kuidas arvutada peptiidide isoelektriline punkt - Elu
Kuidas arvutada peptiidide isoelektriline punkt - Elu

Sisu

Peptiidid on aminohapetest koosnevate lühikeste polümeeride fragmendid. Igal peptiidil on teatud aminohapete järjestus, mida tähistatakse kolmetähelise koodiga või ainult ühe tähega; näiteks aminohape alaniin on lühendatud kui "Ala" või "A". Peptiidide koormus lahuses sõltub selle happesusest. Isoelektriline punkt (pl) viitab lahuse happesuse väärtusele, milles peptiidimolekuli netolaeng on võrdne nulliga. Peptiidi lahustuvus on isoelektrilises punktis minimaalne. Kasutage peptiidi aminohappejärjestuse pI väärtuse arvutamiseks saadaolevaid veebiservereid.

Samm 1

Järjestage peptiid ühetähelise koodi abil. Näiteks kui peptiidil on aminohappeline järjestus Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alaniin - seriin - glutamiinhape - leutsiin - proliin), oleks ühetäheline järjestus "ASELP". Vajadusel vaadake jaotises Ressursid toodud ühe-kolme tähega teisendustabelit.


2. samm

Serveri sisestamiseks, mis arvutab peptiidi isoelektrilise punkti (pI), kasutage mis tahes brauserit, näiteks Internet Explorerit või Firefoxi; vt Ressursid.

3. samm

Sisestage kasti peptiidi ühetäheline järjestus - meie näites "ASELP" - ja klõpsake nuppu "Arvuta".

4. samm

Lugege reale "Teoreetiline pI / Mw" (teoreetiline pl) antud isoelektrilise punkti (pI) väärtus. Meie näites on pI 4,00. Pange tähele, et server arvutab ka peptiidi molekulmassi (Mw).