Sisu
Tsetüültrimetüülammooniumbromiidi, heksadetsüültrimetüülammooniumbromiidi, palmitüültrimetüülammooniumbromiidi ja tetrimooniumbromiidi keemilised ühendid on kõik tuntud ka CTAB poolt. Kemikaali kasutatakse pH-säilitajana DNA järjestikuses genoomis, eriti taimedes.
Valem CTAB
Erinevate CTAB kemikaalide valemite kogused erinevad laborist sõltuvalt. Kuid kõik koostisosad hõlmavad 1 M Tris HCl, pH 8,0, 0,5 M EDTA, 5 M NaCl ja H2O (mõnikord kaks korda destilleeritud). CTAB komponendi puhul kasutavad mõned laborid tsetüültrimetüülammooniumbromiidi ja teisi heksadetsüültrimetüülammooniumbromiidi.
Taimekudede valmistamine
Taimkoe valmistamine võib sõltuvalt materjalist varieeruda. Seinad ja rakumembraanid tuleb purustada, et pääseda tuumamaterjalile ilma halvenemiseta. Tavaliselt jahvatamisel võimaldab vedelat lämmastikku sisaldav taimne materjal juurdepääsu DNA-le, hoides kahjulikke rakulisi ensüüme ja mitteaktiivseid kemikaale.
Suspensioon ja tsentrifuugimine
Purustatud kude asetatakse CTAB terale ja sisestatakse jooksva veega kaussi. Seejärel segatakse see kloroformiga ja tsentrifuugitakse lahustuvate valkude ja muude materjalide eraldamiseks. Seejärel sadestatakse DNA vesifaasist ja pestakse hoolikalt saastavate soolade eemaldamiseks. Seejärel eemaldatakse puhastatud DNA ja säilitatakse TE slaidil või steriilsel destilleeritud veel.