Sisu
Kunstlik viljastamine omab kodu- ja loomaaedadele mitmeid eeliseid. Vähem on tõenäosus, et loomad vigastatakse paaritamisprotsessi ajal, naise puhul on vähem stressi, mis tavaliselt tuleb koju viia. Kuid ükski reprodutseerimissüsteem ei ole täiuslik, mitte isegi kunstlik viljastamine.
Seaduslikkus
Teatud koduloomade tõugude puhul ei ole võimalik kunstliku viljastamise järglasi registreerida. See on kõige olulisem puhtatõuliste hobuste puhul, kõik tõupuhtad varsad peaksid olema loomuliku paaritumise tulemus, mis tuleb registreerida jockey klubis. Näiteks on Ameerika klubi jockey sellel hetkel eriti jäik ning kui hobust ei saa registreerida, on tal takistuseks jooksmine.
Ovulatsioon
Mõnes liigi puhul on paaritumine naistel ovulatsiooni jaoks vajalik, kuna neil ei ole kindlat perioodi. Näiteks on kasside peenisel (mikroskoopidest kuni tiigriteni) mikroskoopilised selgroogid ja kui need spinid on kraapitud naise vaginaalsele seinale, põhjustavad nad munade vabastamist emakasse. Spetsialisti sõnul ei ole naissoost kassid ovaalseks 20 kuni 23 tundi pärast paaritumist, mis muudab kunstliku viljastamise võimatuks.
Kogumine
Mehe sperma kogumiseks peab inimene kogumajaseadmega väga ohtlikule ja väga ärritatud loomale väga lähedal. Kuigi mõningaid loomi, nagu sigu ja hobuseid õpetati nukudega sõitma, ei ole see süsteem loomaaedade puhul olemas. Näiteks koala pühamu Lone Pine on edukalt sooritanud koalasid tehisvagiinidega, kuid saab koguda sperma ainult pärast tõelise paaritumise lõpetamist. Koalad võivad tekitada tõsiseid vigastusi.
Maksumus
Teiseks oluliseks puuduseks on vedelas lämmastikus kogutud sperma ladustamise märkimisväärsed kulud, saadetakse see naissoost ja küsige seejärel veterinaararstilt seemendamisprotsessi. Näiteks tuleb enne seemendamist anesteseerida hiiglane pandas. Kogumisseadmete, ladustamisrajatiste, transpordi ja veterinaarhoolduse kulud võivad olla suured. Seevastu loomulik reprodutseerimine võib olla suhteliselt odav, eriti kuulekate loomade puhul.
Spekulatsioon
On ka teooria, et loomad peavad omandama reprodutseerimise tegu, vaadates nende vanemate kaaslast. Imetajad ja linnud peavad õppima õppima oma liikide liikmeid. Animal Planeti teadlaste sõnul on see väga suur probleem hiiglaslikes pandades, sest naisel on viljakas periood ainult üks kord aastas. Naine pandad tuleks anesteseerida enne kunstlikku viljastamist. See ei jäta meestele palju aega reproduktiivse käitumise avastamiseks, seal ei ole palju vangistuses olevaid pandasid, kes teavad, kuidas kaasas olla. Kui kõik loomad on kunstlikult viljastatud, on see aja jooksul ainus teadaolev meetod paljunemiseks.